Organik gübre kullanımı tarıma ve doğaya pek çok fayda sağladığı gibi, üretici ve tüketiciye de pek çok fayda sağlamaktadır. Organik gübrenin avantajlarından bazıları aşağıda belirtilmiştir.

• Üretilen ürünün kalite ve miktarı artar.
• Bitki  zararlı böceklere karşı direnç kazanır.
• Bitkinin büyüme hızını arttırır. Böylelikle bitkinin erken ürün vermesini sağlar.
• Organik gübrenin içinde bulunan toprak için gerekli mineraller sayesinde de toprağı verimli hale getirir.
• Bitkinin ve Toprağın susuzluğa karşı direnci artar.
• Yetiştirilen bitki suya daha az gereksinim duyar. Sulama konusunda gereksiz su harcamasının önüne geçilir.
• Organik gübre toprağın rengini koyulaştırarak toprağın daha fazla güneş ışığını emmesi sağlanır.
• Toprağın geçirgenliğini arttırarak hava ve su alımını kolaylaştırır.
• Toprağa verilen azot miktarının bitkiye dengeli bir biçimde dağıtır.
• Suyun eritemediği kireci eritir ve eritme sonucu çıkan karbondioksiti fotosentezde kullanılır.(kükürt takviyeli organik gübreler için geçerlidir)
• Toprakta bulunan tuzu bitkinin kök kısmından uzaklaştırarak bitkiye zarar vermesini engeller.(kükürt takviyeli organik gübreler için geçerlidir)
• Toprakta bulunan bitki gelişimi için gerekli olan demiri bitkinin alabileceği şekle dönüştürür.
• Organik gübre bitkide hücre bölünmesini arttırarak bitkinin büyüme hızını arttır.